Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SNAPC4Q5SXM2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SNAPC4Q5SXM2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SNAPC4Q5SXM2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SNAPC4Q5SXM2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
SNAPC4Q5SXM2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SNAPC4Q5SXM2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SNAPC4Q5SXM2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SNAPC4Q5SXM2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms