Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms