Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFDP3Q5H9I0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms