Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms