Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ53S08 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6CQ53S08 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.7 ms