Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC92Q53HC0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC92Q53HC0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms