Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL12Q53G59 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms