Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGAP29Q52LW3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP29Q52LW3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms