Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC39A12Q504Y0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A12Q504Y0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms