Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms