Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL9Q3SXZ7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL9Q3SXZ7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms