Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSM12Q3MHD2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms