Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms