Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC96Q2M329 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms