Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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