Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms