Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms