Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPROQ16827 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPROQ16827 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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