Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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