Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMA3Q16787 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA3Q16787 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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