Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B3Q16720 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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