Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2Q16621 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFE2Q16621 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFE2Q16621 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2Q16621 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2Q16621 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2Q16621 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2Q16621 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2Q16621 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2Q16621 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2Q16621 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2Q16621 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2Q16621 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2Q16621 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2Q16621 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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