Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms