Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RPE65Q16518 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPE65Q16518 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPE65Q16518 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPE65Q16518 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPE65Q16518 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPE65Q16518 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPE65Q16518 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPE65Q16518 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPE65Q16518 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RPE65Q16518 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPE65Q16518 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPE65Q16518 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RPE65Q16518 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPE65Q16518 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPE65Q16518 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPE65Q16518 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPE65Q16518 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPE65Q16518 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPE65Q16518 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPE65Q16518 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPE65Q16518 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPE65Q16518 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPE65Q16518 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPE65Q16518 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPE65Q16518 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPE65Q16518 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RPE65Q16518 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPE65Q16518 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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