Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NTRK3Q16288 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms