Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
VPS72Q15906 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms