Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDSNQ15517 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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