Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIV2LQ15477 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms