Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH1Q15438 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms