Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP1Q15431 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms