Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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