Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR6A1Q15406 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR6A1Q15406 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR6A1Q15406 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR6A1Q15406 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR6A1Q15406 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR6A1Q15406 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NR6A1Q15406 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NR6A1Q15406 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NR6A1Q15406 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NR6A1Q15406 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR6A1Q15406 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR6A1Q15406 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NR6A1Q15406 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR6A1Q15406 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR6A1Q15406 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR6A1Q15406 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR6A1Q15406 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NR6A1Q15406 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR6A1Q15406 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR6A1Q15406 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR6A1Q15406 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NR6A1Q15406 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR6A1Q15406 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR6A1Q15406 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR6A1Q15406 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR6A1Q15406 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NR6A1Q15406 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR6A1Q15406 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NR6A1Q15406 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR6A1Q15406 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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