Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX1-1Q15270 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
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