Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN5AQ14524 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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