Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX2Q13950 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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