Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP1Q13835 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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