Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA9Q13797 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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