Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1A4Q13733 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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