Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
PTCH1Q13635 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTCH1Q13635 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
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