Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTM1Q13496 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms