Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PICALMQ13492 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PICALMQ13492 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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