Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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TOP3AQ13472 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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