Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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