Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE3BQ13370 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
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