Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB3BPQ13352 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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