Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SKP2Q13309 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP2Q13309 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SKP2Q13309 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SKP2Q13309 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SKP2Q13309 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SKP2Q13309 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SKP2Q13309 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKP2Q13309 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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