Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GRIN2BQ13224 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
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