Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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ERCC8Q13216 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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ERCC8Q13216 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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ERCC8Q13216 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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