Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3BQ13214 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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