Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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CSTF3Q12996 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms